液体次氯酸钠在消毒上是具有明显优势的，作为一种广谱、安全的强力灭菌、杀病毒药剂，它同水的亲和性很好，能与水任意比互溶不存在液氯，二氧化氯等药剂的安全隐患且消毒效果被认为和氯气相当，也正是因为这一特点所以它消毒效果好投加准确操作安全，使用方便，易于储存，对环境无毒害，不存在跑气泄露，可以任意环境工作状况下投加。
    液体次氯酸钠广泛应用于包括中水、工业循环水、游泳池水、医院污水等等各种水体的消毒，次氯酸钠还能够破坏氰根离子和苯环等用作处理含氰废水和一些工业中毒污染废水的氧化，还可以用于纸浆等漂白高浓度的次氯酸钠液体还可以用于剥离设备及管道上附着的沾泥。
    在消毒方面，值得肯定的是，由于次氯酸钠发生器所生产的消毒液中不象氯气、二氧化氯等消毒剂在水中产生游离分子氯，所以，一般难以形成因存在分子氯而发生氯代化合反应，生成不利于人体健康的有毒有害物质。并且，次氯酸钠也不会像氯气同水反应会形成盐酸那样，对金属管道构成严重腐蚀。不过，它同氨可以发生反应，在水中生成微量的带有气味的氯氨化合物，但这种物质也是一种安全的杀生药剂，只是远不及次氯酸钠的杀生能力。
    液体次氯酸钠除了消毒，还有以下作用：
    1.用于纸浆、纺织品（如布匹、毛巾、汗衫等）、化学纤维和淀粉的漂白。
    2.制皂工业用作油脂的漂白剂。
    3.化学工业用于生产水合肼、单氯胺、双氯胺。也用于制造钴、镍的氯化剂。
    4.染料工业用于制造硫化。
    5.水处理中用作净水剂、杀菌剂。