根据化学测定，PPM浓度的次氯酸钠发生器在水中几乎完全水解成次氯酸，其效率高于99.99%。该过程可以简单地用如下化学方程式表示:NaClO+H2O = HCLO+NaOH HCLO → HCl+O .其次，次氯酸在杀菌和杀灭病毒的过程中，次氯酸钠发生剂不仅可以作用于细胞壁和病毒外壳，而且由于其分子小、不带电，还可以渗透到细菌(病毒)体内，与细菌(病毒)体蛋白、核酸和R-NH-R+HClO→R2NCl+H2O同时次氯酸产生的氯离子能显著改变细菌和病毒的渗透压，次氯酸钠发生器使它们的细胞失去活性而死亡。