次氯酸钠发生器还能分解蔬菜、水果等农副产品上残留的微量药物。大部分药物都是由有机物组成的，次氯酸钠发生器释放的新氧气可以氧化分解这些物质。次氯酸钠发生器无疑对现代农业和果蔬包装行业的发展起到了巨大的推动作用。可以肯定的是，由于次氯酸钠发生器产生的消毒剂不会像氯气、二氧化氯等消毒剂一样在水中产生游离氯，一般很难因游离氯的存在而形成对人体健康有害的致癌物。与臭氧不同，空气中只要有很微弱的量(0.001mg/m3)，就会对生命造成伤害和毒害。此外，次氯酸钠发生器不会对金属管道造成严重腐蚀，因为氯气蕞终会与水反应生成盐酸。