在一些文献中，氯的消毒是由有效氯计算的，次氯酸钠的有效氯为95.3%。一般来说，污水处理厂使用由工厂制备的次氯酸钠，直接运输到工厂进行添加。次氯酸钠溶液浓度在12~15%之间，转换为有效氯在11~13%之间。因此，在购买次氯酸钠时，污水处理厂不应被一些企业误导。一般来说，有效氯约为10%是正常的。高于此值的假成分较多，浓度越高，次氯酸钠越容易挥发。在污水处理厂的储存过程中，很容易挥发和降低浓度。储罐顶部应注意氯气释放孔，储存空间应强制排气，防止有毒气体积累。

污水处理厂的出水须经过消毒，因为城市生活污水中含有大量的微生物，包括对人类有害的细菌、原生动物的卵囊虫、细胞囊、蠕虫、病毒等。许多有害微生物的检测工作量非常大，为了更快地检测污水中有害微生物的数量，粪便大肠菌群作为污水处理厂的生物危害指标，污水处理厂在出厂前，进行相应的过程，将粪便大肠菌群减少到一定的指标范围内，使污水中的有害微生物降低环境可接受，这是污水处理厂的消毒。应注意的是，污水处理厂的消毒不是消毒，消毒可以达到一定数量，消毒是全部消毒。